Dans la série classique "Les 13 fantômes de Scooby-Doo", la bande a capturé 12 des 13 terrifiants fantômes. Mais qu'est-il arrivé au 13ème ? Avec leur ancien partenaire Vincent Van Ghoul, Scooby-Doo et ses amis se préparent pour attraper le dernier fantôme et fermer pour toujours le Coffre des Démons

Cherchant à laisser leur carrière d'enquêteur derrière eux, l'équipe de Scooby-doo part pour un voyage tous frais payés sur une mystérieuse - mais étrangement familière - île tropicale. Leur voyage va cependant prendre une nouvelle tournure dès lors qu'ils rencontrent les zombies qui peuplent l'île.

Un hôtel historique, un grand chef 5 étoiles déterminé, un étrange camp de cuisine et un fantôme espiègle sont une bonne recette pour un désastre. Mais pour Scooby-Doo et sa bande, c’est juste une nouvelle enquête.

La bande à Scooby visite un ranch de tourisme et découvre que la ferme et la ville située à proximité sont hantées par le spectre d’un cowboy nommé Dapper Dan, capable de lancer du feu bien réel grâce à ses tisonniers. Le mystère ne fait que grandir lorsqu’il s’avère que le fantôme est un lointain parent de Shaggy Rogers !

Scooby et le gang assistent à une compétition de course off-road, où ils tombent sur un fantôme menaçant nommé Inferno, qui tente de saboter la course et de provoquer le chaos . Avec l'aide de la WWE Superstars Triple H, Paige et Sheamus, ainsi que d'un nouveau partenaire de Scooby, The Undertaker,Scooby-Doo et le Mystère Inc. gang vont essayer de sauver la course avant qu'il ne soit trop tard.

Le Scooby-gang est de passage à New-York, et en profite pour visiter le musée officiel du groupe de glam-rock KISS ! Mais un terrible démon hante ces lieux, en la personne de Gene Simmons lui-même !

Une nouvelle affaire terrifiante pour le Scooby-Gang : lorsque Véra hérite d'un vieux château transylvanien, elle ne se doute pas qu'il est déjà habité par l'horrible monstre "Frankenflippant". Scooby, Sammy, Fred et Daphné décident alors de l'aider à résoudre ce mystère…

Lorsque Sammy et Scooby-Doo gagnent des billets pour assister à la WrestleMania XXX de la WWE, toute la bande se rend à La Nouvelle-Orléans, ville hôte de l'événement. Cependant, lorsqu'un un monstre apparaît et menace de ruiner l'événement, Scooby-Doo et sa bande demandent aux superstars de la WWE, John Cena, Brodus Clay, AJ Lee, Triple H, The Miz, Kane, Sin Cara et Vince McMahon de les aider à résoudre le mystère.

Scooby-Doo et son gang se rendent à un festival sur le thème des vampires lorsque de vrais vampires malintentionnés tentent de semer le trouble. Les choses empirent lorsque l'un d'eux veut faire de Daphné son épouse...

La bande à Scooby rencontre l’acteur disparu Bleu plomb Falcon lors d’une convention de comics, comme il jure de se venger pour avoir été laissé de côté d’Hollywood. Plus tard, un antagoniste de la série réelle Blue Falcon, M. Hyde, commence à terroriser la convention, essayant d’arrêter la publication du nouveau film de Falcon.

Scooby-Doo et ses acolytes partent se ressourcer en pleine nature, au camp Little More. Toute la bande va vite découvrir que les lieux regorgent de légendes urbaines. En effet, chaque fois que quelqu'un raconte une histoire de fantôme, la créature prend forme. Mais il en faudra plus pour empêcher Scooby-Doo et son équipe de résoudre ce mystère.

Toute la bande de Scooby-Doo se réunit pour aider Madelyn, la jeune sœur de Vera. Celle-ci étudie la prestidigitation à l'Académie Whirlen Merlin, où des phénomènes inexpliqués semblent s'être produits.

Krudsky le Magnifique, un magicien de carnaval raté, dérobe la lumière magique à Willow, la princesse des fées. Scooby-Doo et Sammy ne doivent pas perdre une seconde pour empêcher cela ou sinon tout le monde se verra transformé en horribles monstres d'Halloween. Scooby-Doo et ses amis embarquent alors sur le Train de la Mort en direction du monde fantastique d'Halloween pour récupérer le puissant Sceptre Goblin.

Scooby-Doo et ses amis se retrouvent piégés dans les montagnes glaciales de l'Himalaya, alors qu'ils tentent de combattre l'abominable homme des neiges...

Scooby-Doo et tous ses amis embarquent à bord d'un bateau pour une croisière dans le Triangle des Bermudes. Rapidement, l'expédition prend une tournure catastrophique. En effet, la bande de Scooby-Doo se retrouve confrontée à toutes sortes de créatures terrifiantes. Scooby-Doo doit faire preuve d'un courage à toute épreuve pour affronter spectres, extraterrestres et pirates fantômes. Ces derniers sont sans conteste les plus redoutables, puisqu'ils coulent les navires croisant dans les eaux du Triangle des Bermudes à coup de boulets de canons...

Scooby Doo et la bande de Mystères & Co doivent résoudre une enquête en Egypte.

Scooby-Doo et ses amis se rendent à Hawai pour assister à la grande compétition annuelle de surf. Dès leur arrivée, des mystérieuses créatures s'attaquent aux surfeurs. Pensant qu'il s'agit d'une vieille malédiction, nos héros tentent de résoudre ce mystère...

Scooby-Doo et le gang débarquent en Écosse pour élucider le plus grand mystère qui soit : celui du monstre du Loch Ness...

Fred, Daphné, Shaggy, Velma et leur fidèle chien Scooby-Doo ont dissous la formidable équipe qu'ils formaient pour mener leur propre destiné. Cette période de leur adolescence où mener des enquêtes et démystifier les coups bien orchestrés est maintenant chose du passé. C'est la nouvelle attraction de l'île de peur, fertile en frissons de tout genre, qui a la cote chez les jeunes aujourd'hui. Cet immense parc au large des côtes attire les foules, plus particulièrement les adolescents. Toutefois, ils n'en reviennent pas tous le teint aussi enjoué... Sans le savoir, les membres de la Mystery Machine sont tous convoqués pour passer une nuit sur cette île mystérieuse.

Scooby-Doo et Sammy sont employés comme professeurs dans un collège spécialisé pour les enfants de monstres. D'abord terrorisés, nos héros finissent par s'attacher à leurs élèves et quand un groupe est enlevé par la sorcière Reevolta, ils volent à leur rescousse ...