Dans les profondeurs de la jungle, l'aventurier Nigel Putnam est chargé de traquer un crocodile géant qui menace le monde. Pendant ce temps, l'USS Gibson capture un requin d'environ un kilomètre de long. Mais le monstre s'échappe et détruit tout sur son passage. Pour s'en débarrasser, Nigel ne voit qu'une solution : faire s'affronter les deux créatures afin qu'elles s'entretuent...

Une grande partie de l’Amérique du Nord est en ruine et le reste du monde se prépare à un terrible Sharknado mondial. Fin et sa famille vont devoir mettre un terme à cette catastrophe avant que la Terre ne soit totalement détruite.