En 1808, l'enquêteur Wong Gyu est envoyé sur une île située au large des côtes coréennes. Chargé au départ d'élucider un incendie criminel, il se retrouve à enquêter sur une série de meurtres. Personne ne semble vouloir coopérer et Wong Gyu prend rapidement conscience de la complexité de cette affaire, notamment liée aux us et coutumes des habitants de l'île...
Doomsday Book nous présente trois récits ayant pour thème commun la fin de l'Humanité. En premier, « A Brave New World » nous plonge au cœur d'une épidémie décuplant l'agressivité et la libido des infectés, qui prennent graduellement l'apparence de zombies. Il sera suivi de « The Heavenly Creature » où le guide robotisé d’un temple serait peut-être la dernière réincarnation de Buddha. Et enfin, « Happy Birthday », où une fillette commande une boule de billard sur le Web pour remplacer celle qu'elle a brisée. Deux ans plus tard, sa famille et elle se préparent à l'arrivée d'un météore se déplaçant à une vitesse foudroyante en direction de la Terre.