Un petit garçon découvre qu’il possède des pouvoirs surnaturels et qu’il n’est pas né sur Terre. Plus tard, il s’engage dans un périple afin de comprendre d’où il vient et pourquoi il a été envoyé sur notre planète. Mais il devra devenir un héros s’il veut sauver le monde de la destruction totale et incarner l’espoir pour toute l’humanité.
Le film se concentre sur l'histoire du Battlestar Pegasus, il se passe juste après la promotion de Lee Adama en tant que commandant du Battlestar Pegasus (saison 2, épisode 17, "Une main de fer"), de fréquents flashbacks montrent les événements vus du Pegasus entre l'attaque des Cylons et le présent, deux flashbacks montrent des événements de la première guerre contre les Cylons (un sur l'amiral Helena Cain, fuyant l'attaque des Cylons sur Tauron alors que sa petite sœur était tuée par les machines, un autre sur la découverte d'un centre de recherche Cylon visant à fabriquer un hybride cylon/humain).
Dans une boîte de nuit de Singapour, Matt Ellman s'apprête à demander en mariage sa petite amie Jessie. Mais un attentat perpétré par un kamikaze les tue tous les deux. Peu de temps après, Matt se réveille dans un monde mystérieux, sur les rives d'un immense fleuve. Autour de lui, il découvre des milliers d'individus ayant vécu sur Terre à différentes époques, mais il ne trouve pas trace de Jessie. Matt se lance alors à sa recherche, accompagné par d'intrépides compagnons. Ensemble, ils remontent le fleuve, pour tenter de découvrir sa source, espérant y trouver la réponse à leurs très nombreuses questions...
Alec est un chevalier courageux et impétueux. Convoqué par les anciens, il est de retour dans son village natal où Cid, terrifié, lui raconte la légende du Jabberwocky, cette créature ailée au corps de dragon et aux griffes meurtrières. Bientôt, pour sauver son village de la destruction et la vie de ses amis, Alec devra affronter l'effrayante créature...
Lieutenant de police, Diane Harkin désire se consacrer aux affaires de harcèlement. Il y a une raison bien personnelle à ce choix : elle-même subit depuis quelques temps les menaces de son ex-mari. Récemment mutée à Seattle, elle commence donc une nouvelle vie avec son jeune fils. La première victime dont elle s'occupera, accompagnée de Julia Whitman, une brillante substitut au procureur, sera une jeune femme poursuivie par son ancienne maîtresse...
Jennifer Riley doit retourner dans la ville où elle a grandi pour aider sa sœur, accusée du meurtre de son collègue, un journaliste à scandales. Jennifer a quitté cet endroit il y a plus de vingt ans, après la disparition de sa meilleure amie, Abby. Tout le monde en ville la croit encore responsable de cette disparition et le retour est amer. Jennifer retrouve Heyden, le frère d'Abby dont elle était amoureuse et avec lequel Jennifer avait passé la nuit le soir de la disparition de son amie. Jennifer reçoit des menaces par SMS, mais elle ne se résout pas à abandonner sa sœur et fait tout pour la disculper.