Dans la ville côtière de Cape Town, en Afrique du Sud, deux jeunes filles sont attaquées par un requin mutant. Samantha arrive à s'en tirer tandis que sa soeur Amy est dévorée par cet horrible monstre. Le docteur Harris arrive rapidement à capturer la bête et en fait l'attraction principale d'un parc aquatique. Mais quand le requin s'enfuit après avoir fait un carnage, à quelques jours d'une compétition de surf, la panique se propage dans la ville. Samantha et le docteur Harris s'associent à un chasseur afin de traquer la bête. Ils vont bientôt découvrir qu'il y en a beaucoup d'autres...
Burt Gummer et son fils Travis Welker tombent sur des Graboïds et des Ass-Blasters alors qu'ils se rendent au Canada pour enquêter sur la multiplication d'attaques mortelles de vers géants. Arrivés dans une usine reculée de la toundra, Burt soupçonne que les Graboïds soient secrètement transformés en armes, mais avant qu'il puisse le prouver il est contaminé par du venin de Graboïd. Alors qu'il ne lui reste plus que 48h à vivre, son seul recours est de créer un antidote mais, pour cela, il faut que quelqu'un trouve comment on peut traire un Graboïd.