Au XVIème siècle, l'Inde est dominée par la dynastie des empereurs musulmans moghols. Le dernier héritier, Jalaluddin Muhammad, un farouche guerrier, multiplie les batailles pour agrandir le territoire de l'empire. Afin d'unifier tout l'Hindoustan, il consent à épouser Jodhaa, une princesse Rajpoute hindoue. Mais une fois mariés, celle-ci demeure distante avec Jalaluddin, refusant d'être la victime d'une alliance politique...

Rahul, célibataire de 40 ans, entreprend un voyage vers le sud de l'Inde au sein du "Chennai Express" pour réaliser le dernier vœux de son père défunt. Mais il ne savait pas que ce voyage allait se transformer en une aventure rocambolesque pleine de surprises ... mauvaise et bonne !