Sur l'île d'Amami, les habitants vivent en harmonie avec la nature, ils pensent qu'un dieu habite chaque arbre, chaque pierre et chaque plante. Un soir d'été, Kaito, découvre le corps d¹un homme flottant dans la mer, sa jeune amie Kyoko va l'aider à percer ce mystère. Ensemble, ils apprennent à devenir adulte et découvrent les cycles de la vie, de la mort et de l'amour…

Lorsqu’une épidémie de grippe canine envahit la ville japonaise de Megasaki et menace de contaminer les hommes, le maire ordonne la mise en quarantaine de tous les chiens. L’île poubelle devient : l’Île aux Chiens. Un jeune garçon de 12 ans, Atari, se rend sur place à la recherche de son chien perdu, Spots. C’est alors qu’il fait la découverte, à l’aide d’une meute de cinq chiens, d’une conspiration qui menace la ville.

Mitsuhama, une petite ville portuaire du Japon sans intérêt. Abandonnés par leurs parents, Taira et Shōta Ashiwara, deux frères adolescents, vivent dans un chantier naval en bord de mer. Taira se bat souvent avec les élèves d’un autre quartier de la ville, mais un jour il disparaît après avoir été passé à tabac. Tandis que Shōta part à sa recherche, Taira se lance dans une violente expédition dans les rues de la ville, en quête d’hommes costauds à frapper, ne suivant que l’obstination de son ego qui refuse la défaite. Arrêtera-t-il un jour de se battre ?