Le soldat Joe Armstrong et le sergent Curtis Jackson débarquent sur l'île de Saint Thomas, dans les Caraïbes. Ils ont pour mission Top Secrète d'enquêter sur plusieurs disparitions mystérieuses de soldats américains... Très rapidement, Joe Armstrong et Curtis Jackson découvrent l'existence d'une base secrète où les militaires disparus sont reconditionnés pour devenir de redoutables guerriers Ninjas. Spécialement entrainés ils sèment la mort partout sur leur passage !

Lee Cullen, cadre de la Cyrez, importante société d'armement américaine, découvre par hasard que ses patrons sont impliqués dans un trafic d'armes et s'apprêtent à livrer des armes très sophistiquées à des trafiquant russes. Elle prévient aussitôt le FBI et réussit à recopier sur deux disquettes les preuves de ce trafic. Surprise, elle prend la fuite sous la protection du FBI. John Kruger, surnommé l'effaceur, qui assure la sécurité d'informateurs impliqués dans les grandes affaires criminelles va la prendre sous sa protection.