Deux ans après s'être résolus à fermer la Mystère & Cie, le super-chien Scooby-Doo et ses amis Fred, Daphné, Sammy et Véra se retrouvent sur Spooky Island. Les 5 limiers au flair inimitable ont été appelés sur place après une cascade d'incidents paranormaux dans l'immense parc d'attractions de Spring Break. L'excentrique Émile Mondavarious, le maître de l'île, craint que le site ne soit réellement hanté, et compte sur la joyeuse bande pour résoudre au plus vite ces troublantes énigmes et mettre un terme à la fuite de sa richissime clientèle.Oubliant leurs petits désaccords, les cinq acceptent avec enthousiasme cette périlleuse mission. Faux esprits, monstres bidons, effets spéciaux... Scooby-Doo et ses copains croyaient avoir tout vu. Mais à Spooky Island, ils ne sont pas au bout de leurs surprises.

A year after the boys crossed dimensions, discovered magic and battled the restoring demon, they are back home in Bremin and are struggling with everyday teenage life. Felix has high hopes for the four heroes. He wants them to push the limits of their magical ability, working as a team to become masters of the arcane. But although he's unwilling to admit it, the boys have grown apart. The boys, once in perfect magical and elemental alignment, are a tangle of rivalry and distrust. On the verge of separating, the Nowhere Boys are drawn together for one last spell when Felix discovers a magically sealed 'Book of Shadows'. Unwittingly this releases a powerful force of chaos, and the gang is reluctantly drawn into a showdown that threatens their world and all they love...