Dans un petit village de l’Ouest du Japon, une école n’accueille que 6 élèves, dont Soyo, seule élève de dernière année. Un jour arrive un nouvel élève, Hiromi Osawa, venu de Tokyo. Les 2 élèves se rapprochent progressivement au long de l’année, qui sera la dernière dans cette école avant de partir au lycée...

La lignée des Joestar traverse les âges et les univers parallèles. Grâce à leurs stands, des pouvoirs psychiques utilisés pour se battre, les membres de cette famille issue de l’Angleterre victorienne parviennent à repousser les entités surnaturelles qui menacent la Terre. Ici, Josuke devra faire preuve d’exploits pour sauver sa ville, en proie à d’étranges événements. Dans la ville de Morioh, Higashikata Josuke est le fils illégitime de Joseph Joestar. Il possède un Stand, nommé Crazy Diamond, qui lui permet notamment de réparer les objets cassés.

Les Yorozuya vont chasser des scarabées dans la forêt. Par hasard, ils rencontrent le Shisengumi. Après plusieurs péripéties, Okita previent Gintoki qu'un tsujigiri (personne qui teste l'efficacité de son nouveau katana en s'attaquant à un adversaire humain) s'en prend à de nombreuses personnes. Au même moment, Gintoki reçoit une requête : il doit retrouver le voleur du Benizakura, un sabre qui serait maudit...