Six ans après avoir mystérieusement disparu du poste de police d'Haddonfield, Michael Myers est de retour. Sa nièce, Jamie Lloyd, retenue en otage par une secte, arrive de justesse à s'échapper avec l'enfant qu'elle vient de mettre au monde. Mais rapidement le lien entre la secte et Myers est connu, et le croquemitaine retrouve la jeune femme et la tue. Pendant ce temps, la petite ville d'Haddonfield se prépare à passer un 31 Octobre sans fêter Halloween, l'ombre des meurtres du boogeyman survolant encore sur la ville. De son côté, le docteur Samuel Loomis sort de sa retraite pour traquer à nouveau Michael...

Craig Schwartz est marionnettiste de rue, mais ne parvient pas à vivre de son art. Lotte, son épouse, s'intéresse beaucoup plus à ses animaux qu'à lui. Devant leurs difficultes financières, le jeune homme trouve un emploi au septième étage du building de l'entreprise Lester. En classant des dossiers, Craig découvre une porte dérobée et l'emprunte. Celle-ci le conduit pour quinze minutes à l'intérieur de John Malkovich. Cette prodigieuse découverte va lui permettre de changer de vie.