En sauvant Celebi, le Pokémon légendaire qui peut voyager dans le temps, des griffes d'un braconnier, le jeune Sammy est projeté dans le futur, à l'époque de Sacha et co. Avec l'aide de ses derniers, il part à la recherche du Pokémon fée pour pouvoir rentrer chez lui, mais c'est sans compter sur la présence d'un célèbre braconnier de la Team Rocket qui est lui aussi sur les traces du Pokémon temporel.
An 0079 du Calendrier Universel. Le White poursuit son périple à travers le globe, avec à ses trousses, les troupes d'élites et les commandos des Forces de Zeon. Pour Amuro et ses amis, c'est l'entrée de plein pied dans la guerre, avec ses horreurs et ses dures réalités. La fin de leur périple signifiera-t-elle pour eux la délivrance ou le début d'un voyage plus effrayant encore ?