L'histoire commence là où la série s'était terminée, lorsque Gordon Shumway - mieux connu sous le nom de Alf, acronyme de "Alien Life Form" - est capturé par la Task Force Alien de l'US Air Force alors qu'il tente de quitter la Terre. Alf est alors enfermé à la base Edmonds, sous les ordres du colonel Milfoil. Ce dernier prévoit de tuer Alf pour les besoins d'un produit de beauté, en prenant soin de laisser une lettre mettant en cause son aide de camp, le lieutenant Reese, comme bouc-émissaire. Apprenant cela, 2 scientifiques de l'US Air Force - le major Mellisa Hill et le capitaine Rick Mullican - décident d'aider Alf à s'échapper, et parviennent à se réfugier dans un motel. La police et l'armée alertées, les 3 fugitifs se tournent alors vers Dexter Moyers, un ancien scientifique de la NASA. Son idée est de révéler au monde entier l'existence de Alf. Cependant, Mélissa découvre que Moyers a comme plan secret de vendre Alf au plus offrant.

Los Angeles, années 50. Alors que la ville est sujette à une vague de règlements de comptes après la chute du caïd Mickey Cohen, la police criminelle se mobilise toute entière sur l’affaire de L’Oiseau de nuit, un massacre au cours duquel est tombé un ancien flic. Trois inspecteurs au style radicalement différent vont être amenés à coopérer pour démêler les fils d’une histoire plus compliquée qu’il n’y paraît…

Eddie Burns, un policier à la retraite, ayant consacré quinze années de sa vie à la brigade "homicide" de la ville de Reno se voit forcé de reprendre du service quand sa soeur Kassie disparaît. Eddie devient alors la cible d'une diabolique vengeance menée par Charlie Strom.

Une astronaute revient d'une mission spatiale et a du mal à retrouver sa vie et son apparent parfait rêve américain.