Un commando de la Marine américaine débarque à bord de la station de forage sous-marine DeepCore, afin de porter secours à un sous-marin échoué dans les profondeurs. L'équipe de Bud Brigman accueille ces nouveaux arrivants, ainsi que Lindsey, future ex-femme de Bud. Alors que les travaux de récupération commencent autour du submersible naufragé, l'équipage de DeepCore doit faire face à des phénomènes inexpliqués. Et s'ils n'étaient pas seuls, dans les abysses?
Le vol 47 de la Transcontinental Airlines s'apprête à décoller. En cette veille de Noël, il y a peu de passagers et la jeune hôtesse de l'air, Teri Halloran, se prépare pour un vol de routine. Cependant l'avion transporte deux prisonniers, Stubbs, un braqueur et Weaver, un tueur en série, escortés par des agents fédéraux. Le vol de routine de Teri va vite se transformer en cauchemar quand Stubbs, en tentant une prise d'otages, parvient à éliminer les agents fédéraux...
Logan a tout juste le temps de cacher le fabuleux diamant qu'il vient de dérober dans un immeuble en construction avant de se faire arrêter. Libéré deux ans plus tard, il n'a qu'une idée en tête: récupérer le fameux joyau. Mais l'immeuble est aujourd'hui occupe par un commissariat. Pour s'y introduire, Logan imagine alors de se faire passer pour un policier, le détective Malone.
À Los Angeles, Gordy Brewer, vétéran des sapeurs-pompiers, arrive avec quelques minutes de retard à un rendez-vous et assiste, impuissant, à un attentat à la bombe contre le Consulat de Colombie. Le terroriste visait une poignée de hauts dignitaires colombiens œuvrant à la signature d'un traité de coopération avec les États-Unis. Parmi les victimes de cet attentat figurent des dizaines de passants innocents dont Anne et Matt Brewer, l'épouse et le fils de Gordy. Cet acte terroriste est rapidement imputé au dangereux criminel Claudio "El Lobo". Alors que l'enquête officielle piétine et que les autorités américaines n'ont pas l'intention de mettre la main sur le principal responsable, Gordy décide de venger la mort de ses proches en partant en Colombie sur les traces de Claudio.
Une série de petites secousses captent l’attention du docteur Clare Winslow, une sismologue qui prédit l’arrivée, dans quelques jours, d’un séisme catastrophique qui menace d’anéantir la région de Los Angeles. Les minutes sont comptées, mais Clare hésite à divulguer une information qui pourrait créer un état de panique générale dans la ville. Peu soucieux des conséquences et à l’encontre même de la volonté politique, un journaliste décide de publier la nouvelle. Un état d’hystérie, et de confusion massive se propage dans la ville, alors que frappe le plus grand séisme de l’histoire de la Californie...