Trois petites histoires composent Memories. La première : "Magnetic Rose" , deux voyageurs de l'espace sont aspirés dans un monde parallèle sur un astéroïde. Un monde créé par les souvenirs d'une femme. Dans la deuxième, "Stink Bomb" , un jeune assistant dans un laboratoire se transforme accidentellement en un arme biologique humaine qui menace Tokyo. L'épisode final et troisième, "Cannon Fodder" , relate un jour de la vie d'une ville qui a pour unique préoccupation d'anéantir ses ennemies.

En sauvant Celebi, le Pokémon légendaire qui peut voyager dans le temps, des griffes d'un braconnier, le jeune Sammy est projeté dans le futur, à l'époque de Sacha et co. Avec l'aide de ses derniers, il part à la recherche du Pokémon fée pour pouvoir rentrer chez lui, mais c'est sans compter sur la présence d'un célèbre braconnier de la Team Rocket qui est lui aussi sur les traces du Pokémon temporel.

Naruto, Kakashi, Sakura et Lee sont envoyés en mission pour escorter un prince durant son voyage à travers le monde pour ensuite le ramener chez lui, au pays de la Lune. Étant un pays très riche, le prince n'hésite pas à acheter tout ce qu'il voit, et lors de son voyage il tombera sur un cirque qui possède un tigre à dents de sabre très rare et le prince veut le posséder à tout prix. Il achète alors le zoo entier. La mission de l'équipe 7 et Lee qui était de simplement protéger le prince se transforme en une mission pour protéger et le prince qui n'écoute personne et les animaux qu'il vient d'acheter. Mais ils parviennent malgré cela à rentrer au pays de la Lune, indemnes. Cependant, trois ninjas aux techniques terrifiantes les attendent.

La jeune Ai emménage dans un paisible village peuplé d'animaux dont le mode de vie est semblable à celui des Humains. Très vite, elle se fait des amis et s'établit dans ce village. Ce film adapte la série de jeux "Animal Crossing" et reprend assez fidèlement son univers doux et coloré.

Un certain Melvin, alchimiste maîtrisant l’eau, s’échappe de la prison de Central City. Ed et Al partent à sa recherche à Table City où une chimère loup les accueille. Ils font également la connaissance de la très jeune Julia, originaire de Milos, qui souhaite retrouver les assassins de son père…

Dans le village de Konoha, deux années après la 4ème grande guerre des ninjas, Naruto s’apprête à célébrer la fête de l’hiver entouré d’Hinata et de ses amis. Soudain, une météorite déchire la nuit de son intense lumière et voilà que la lune se rapproche anormalement de la Terre. Le Conseil des Kage se réunit en urgence face à cette menace de destruction de la planète ! Pour Naruto, Sakura, Shikamaru, Saï et Hinata le compte à rebours pour sauver la planète a commencé.

Quelque temps après le Tournoi du Pouvoir, la Terre est paisible. Son Goku et ses amis ont repris leur vie. Cependant, avec son expérience du Tournoi, Son Goku passe son temps à s'entraîner pour continuer à s'améliorer car ce dernier est conscient qu'il reste encore beaucoup d'individus plus forts à découvrir au sein des autres univers. Lorsqu'un jour, le vaisseau de Freezer refait surface sur la Terre. Celui-ci est accompagné d'un Saiyan, nommé Broly, avec son père, Paragus. La surprise de Son Goku et Vegeta est immense puisque les Saiyans sont censés avoir été complètement anéantis lors de la destruction de la planète Vegeta. Ils n'ont donc pas d'autre choix que de s'affronter, mais ce nouvel ennemi s'adapte très vite aux adversaires qu'il affronte…