Dans un futur proche, la terre est devenue un endroit ruiné et hostile. Menacée par une mystérieuse race de monstres, l'humanité a été forcée de se réfugier sur skyark, une ville construite dans le ciel. Au fur et à mesure que la population a augmenté, l'espace s'est réduit, et seuls les riches ont pu rester, rejetant les pauvres et les orphelins sur la terre. Une révolte est née, mais son leader a été exécuté par les autorités. Son fils, rags, marqué des 13 ombres de la honte est exilé sur la terre où il découvre une prophétie selon laquelle le fils d'un commandant rebelle sauvera le monde. Rags doit maintenant mener ses compagnons orphelins contre une horde de monstres pour retourner sur skyark et y ramener la paix.
Années 1960. Linda est une jeune fille perdue. Elle s'enfuit de chez ses parents à l'âge de seize ans et part pour Los Angeles, où elle vivote, entre drogue et sexe, au sein de la jeunesse hippie. Elle y rencontre Bobby. Ils tombent amoureux, se marient et ont un enfant. Mais Bobby décide de partir en Amérique du Sud pour «ses affaires», laissant à nouveau Linda livrée à elle-même, un enfant sur les bras. Un jour, elle rencontre Susan dans un restaurant. Celle-ci lui propose de venir vivre avec elle dans sa communauté, «la famille», dans un ranch. Cette communauté est celle fondée par Charles Manson
Alors qu’une étrange vague de mystérieuses noyades d’étudiants masculins déferle sur la côte californienne, Jake Graham lutte pour maintenir sa vie à l’école. Il se retrouve traqué par une silhouette cagoulée conduisant une camionnette banalisée, et craint de devenir la prochaine victime des tueurs.