Dorothy n'a qu'un seul rêve en tête: celui de devenir chanteuse. Elle vit au Kansas avec sa tante, son oncle et son meilleur ami Toto. Bientôt elle verra son rêve se réaliser. Emportée par une tornade, elle se retrouve dans le pays du magicien d'Oz. Ce dernier lui promet de faire d'elle une star.

Tex Richman est un homme d'affaire qui compte acheter le théâtre des Muppets. Gary, Marie et Walter la marionnette se mettent alors à la recherche des anciens du théâtre, séparés depuis plusieurs années, afin de tenter de sauver cet endroit qui leur est très cher. Ils arrivent à retrouver Kermit la grenouille qui part à son tour dans le but de réunir ses anciens compagnons de scène.

Suite à leur come back réussi, toute la bande des Muppets part en tournée, triomphant dans les théâtres des plus grandes capitales européennes. Mais bien malgré eux, ils se retrouvent bientôt mêlés à une affaire criminelle d’envergure internationale, un complot dirigé par le redoutable bandit Constantine - qui se trouve être le sosie parfait de Kermit -, et son malfaisant complice Dominic, alias Numéro Deux.