Après avoir été longuement séparés, quatre amis d'enfance se retrouvent dans les forêts du Maine, au nord-est des Etats-unis. Dotés de pouvoirs télépathiques suite à un acte héroïque, ils sont surpris par un blizzard qui cache une mystérieuse force maléfique. Le quatuor doit alors empêcher le massacre de civils innocents et affronter un horrible danger qui menace la Terre.

Pour des raisons inconnues, le noyau interne de la Terre a cessé de tourner sur lui-même. Le champ magnétique de la planète s'effondre, provoquant sous des latitudes diverses une dramatique et spectaculaire série d'accidents. Face à cette catastrophe sans précédent, le gouvernement américain convoque le géophysicien Josh Keyes, une poignée de savants de réputation internationale et un tandem d'astronautes, la major Rebecca Childs et le commandant Iverson. Leur objectif : lancer dans les profondeurs du manteau terrestre une capsule habitée, et provoquer des explosions nucléaires en chaîne pour réactiver le noyau et ainsi sauver le monde d'une destruction imminente.

En plein milieu de la nuit, une employée du FBI est enlevée chez elle... Guidés par un ancien prêtre pédophile aux étranges visions, les agents Whitney et Drummy enquêtent. Très vite, leur investigation s'enlise : les indices sont minces et le temps presse. L'agence gouvernementale décide alors de refaire appel à Mulder et Scully. Leur expérience sur ce genre d'affaires sensibles pourrait s'avérer capitale. Mais des années ont passé depuis la fermeture du service des affaires non-résolues. Scully est redevenue médecin et Mulder, en disgrâce auprès du FBI, est introuvable...

Alors que Charlie Price, ancien scientifique devenu auteur à succès, dédicace son nouveau roman de science-fiction, Joanne Dyson, son ancienne assistante de recherche, est à la tête d'un projet secret baptisé "Danse de la pluie" pour la Fondation scientifique fédérale. Celui-ci est censé fabriquer des nuages et créer de la pluie n'importe où dans le monde. Les essais tournent mal et une terrible tornade s'abat sur la ville où se trouve Price, permettant aux deux anciens collègues de se retrouver et de mettre leurs compétences en commun pour résoudre le problème.

Amber, une femme d'affaires new-yorkaise et célibataire, fait le choix de retourner chez sa tante Dora, une ancienne diva de la soul, pour l'aider à organiser un spectacle musical caritatif de Noël. Elle fait la connaissance d'Allen, un professeur de musique récemment divorcé…