Les inénarrables aventures de l'agent Fox Mulder et de sa coéquipière Dana Scully adaptées ici pour le grand écran. Tout commence par la découverte, au nord du Texas, d'ossements préhistoriques dans une grotte par un jeune garçon. A leur contact un mystérieux parasite pénètre sa peau et envahit son organisme. Le corps de l'enfant est évacué par un certain Bronschweig avant l'arrivée des secours. Mulder et Scully vont bientôt découvrir un projet de guerre bactériologique par la propagation d'un virus. Le nord du Texas servirait de champ d'expérimentation...

2025. La navette spatiale Atlantis manoeuvre dans l'espace lorsqu'un phénomène inexpliqué se produit. Occupés à réparer les pannes, les membres de l'équipage sont propulsés sur une planète sauvage inconnue à l'exception de l'un d'entre eux. Désorientés, les spationautes tentent de comprendre ce qui leur arrive quand, un à un, ils succombent à une force inconnue. Une pendaison, une congélation accélérée, l'attaque d'une créature invisible... Et si cela, aussi cruel soit-il, n'était qu'un jeu, une sorte d'expérience dont les spationautes sont les cobayes ?