Au lendemain de l'inauguration d'un luxueux complexe hôtelier, Martin Brody, le chef de la police d'Amity, apprend la disparition d'une équipe de plongeurs. Il craint le pire. Un requin est déjà venu nager dans les eaux d'Amity quelques années auparavant. Ses inquiétudes ne tardent pas à se confirmer. Un autre accident se produit et le cadavre d'une baleine portant les morsures d'un requin géant échoue sur la plage. Martin Brody alerte immédiatement le maire et lui demande d'interdire la baignade. Mais le conseil municipal refuse de prendre de telles précautions. La saison s'annonce prometteuse et l'enjeu financier est trop important. Brody, devenu trop gênant, est démis de ses fonctions. Le voilà réduit à attendre le pire...

Une entité d'origine extra-terrestre sans précédent se dirige vers la Terre en détruisant tout sur son passage. L'équipage de l'USS Enterprise est chargé de stopper ce nouvel ennemi. Alors que le capitaine Decker se prépare à diriger la mission, il est relevé de ses fonctions et remplacé par le fameux amiral Kirk, absent des commandes du vaisseau depuis trois ans...

Une académie militaire menacée de fermeture devient une forteresse : ses élèves ont décidés d'organiser une mutinerie !