En l’an 1327, dans une abbaye bénédictine, des moines disparaissent. Un franciscain, Guillaume de Baskerville, mène l’enquête, aidé du jeune novice Adso von Melk. C’est l’époque où l’Église, en pleine crise, se voit disputer son pouvoir spirituel et temporel. C’est aussi l’apogée de l’Inquisition.

Un couple marié depuis trois ans revient sur les lieux de leurs premières rencontres, Capri. Le mariage les a éloigné et chacun part à l'aventure. Ils reviendront l'un vers l'autre après quelques lamentables expériences.